当前位置 :首页>基因引物

分子常用试剂配方

发布者:Primerbank 时间:2017-09-29 浏览量:974

试剂配方

 

 

  细菌培养试剂

LB培养基

NaCl 10 g

Yeast extract 5 g

Peptone 10 g

Add dH2O to 1000 ml

Aliquot to 500ml flasks (250 ml per flask). Seal with sealfilm

and autoclave them. Store at room temperature.

LA固体培养基

NaCl 10 g

Yeast extract 5 g

Peptone 10 g

Agar powder 13~15 g

Add dH2O to 1000 ml

Aliquot to 500 ml flasks (250 ml per flask). Seal with sealfilm

and autoclave them. Store at room temperature.

X-gal (20mg/ml):

20mg X-gal溶于1ml 二甲基甲酰胺中,-20℃避光保存;

IPTG (200mg/ml):

1g IPTG溶于4ml去离子双蒸水中,定容至5ml,过滤灭菌后-20℃保存;

Amp100mg/ml

1g Amp溶于4ml去离子灭菌双蒸水中,定容至5ml-20℃保存

  质粒抽提试剂

Solution Ι:

Cell resuspension solution (50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10 mM EDTA, RNase A 100 μg/ml)

1 M  Tris-HCl (pH 7.6) 2.5 ml

0.25 M  EDTA 2.0 ml

ddH2O 45 ml

sterile by autoclave

add 1% RNase 0.5ml

store at room temperature

 

Solution Ⅱ:

Cell lysis solution (0.2 N  NaOH, 1% SDS)

Mix 0.4 N  NaOH and 2% SDS in same volume.

 

Solution Ⅲ:

Neutralization solution (1.32 M  potassium acetate, pH 5.2)

5 M  potassium acetate 13.2 ml

Hac 27 ml

adjust pH to 5.2

add ddH2O to 50 ml

sterile by autoclave

store at room temperature

 

RNaseA: 10mg/ml溶于TE中,在沸水中煮10-30分钟之后分成小份储存于-20℃

  DNA操作试剂

1.5×CTAB:

CTAB                                  15 g

1 M Tris·Cl (pH 8.0)             75 ml

0.5 M  EDTA                        30 ml

NaCl                                    61.4 g

add ddH2O to                    1000 ml


0.5 M EDTA (pH 8.0)

EDTA-Na·2H2O               186.1 g

NaOH                               ~20 g

Adjust to pH 8.0   

dH2O to                          1000 ml

sterilize by autoclaving


1 M Tris·HCl:

 pH 7.4                             pH7.6                     pH 8.0

Tris base                            121.1 g                           121.1 g                   121.1 g

Concentracted HCl            ~70 ml                            ~64 ml                    ~42 ml

dH2O  to                           1000 ml                           1000 ml                 1000 ml

Sterilize by autoclaving


TE (pH 8.0)                               Stock                               vol.

10 mM Tris·HCl (pH 8.0)       1 M                                  10 ml

1 mM EDTA (pH 8.0)            0.5 M                               2 ml

dH2O      to                                                                 1000 ml

sterilize by autoclaving


10 M NH4Ac   

NH4Ac                                    385 g                               770 g

H2O to                                    500 ml                            1000 ml


10×PCR buffer

     stock                                   vol.

500 mM  KCl                      2.5 M(sterilized)                         200 ml

100 mM  Tris-HCl               1 M pH 9.0(sterilized)                100 ml

1% Triton X-100                100%                                      10 ml

ddH2O                                                                              690 ml

sterilize by autoclaving

 

5×TBE

Tris                                           54 g

Boric acid                                  27.5 g

0.5 M EDTA (pH 7.9)                 20 ml

dH2O to                                   1000 ml


10×TAE:  

Tris                                           121.1 g                               484.4 g

EDTA(0.5 M)                             20 ml                                   80 ml

NaAc·3H2O                               17 g                                    68 g

glacial acetic acid                       ~30 ml                                ~200 ml   

adjust to pH 8.1

dH2O to                                   1000ml                                 4000ml


NaOH 

                        10 N                                     4 N

NaOH                                         400 g                                   160 g

dH2O to                                     1000 ml                               1000 ml


2 N HCl:

concentrated HCl 3                      65 ml                                   182.5 ml

dH2O      to                                 2000 ml                                1000 ml


5 mg/ml ssDNA

Salmon sperm DNA                       1 g

ddH2O to                                      200 ml


0.5 M P.B (phosphate Buffer) pH 6.8

Na2HPO4                                       16.44 g                                 131.52 g

NaH2PO4                                       16.11 g                                 128.88 g

dH2O to                                          500 ml                                  4000 ml


20×SSC

NaCl                                                 175.3 g                                701.2 g

Na3Citrate                                         88.2 g                                 352.8 g

dH2O to                                          1000 ml                                 4000 ml

Sterilize by autoclaving


10% SDS 

SDS                                                   100 g

dH2O to                                            1000 ml

Heat to 68 ℃ to assist dissolution


50×Denhart’s Solution

Ficoll 400                                           10 g

PVP-360                                            10 g

BSA (Fraction V)                                 10 g

ddH2O  to                                          1000 ml

 

Southern Blot Hybridization Buffer (Saghai,s Lab):

Final conc.                                          Stock                                          Vol.

5×SSC                                               20×                                          250 ml

50 mM  PB (pH 6.8)                           0.5 M                                         100 ml

5×Denhardt’s                                     50×                                          100 ml

2.5 mM  EDTA (pH 8.0)                      0.5 M                                          5 ml

100 μg/ml  ssDNA                              5 mg/ml                                      20 ml

0.4%SDS                                           20%                                           20 ml

Dextran sulfate                                                                                      50 g

ddH2O  to                                                                                            1000 ml 

(Place a beaker on a stirrer, add these solution in the order of appearance one by one. SDS should be the very last item.)

Washing off Probe for Re-hybridization of Blots (I):

Washing time: 10 min

Final conc.                                          Stock                                          Vol.

0.1×SSC                                          20×SSC                                        20 ml

0.1% SDS                                        10% SDS                                      40 ml

dH2O to                                                                                                4000 ml

 

Washing off Probe for Re-hybridization of Blots (II):

Washing time: 3 min

Final conc.                                            Stock                                           Vol.

0.1 N NaOH                                          10 N NaOH                                  40 ml

0.2% SDS                                            10% SDS                                      80 ml

dH2O to                                                                                                    4000 ml

 

Washing off Probe for Re-hybridization of Blots(Ⅲ):

Washing time: 20 min

Final conc.                                               Stock                                            Vol.

0.2 M  Tris. (pH 7.5)                              1 M  Tris. (pH 7.5)                          800 ml

0.1×SSC                                               20×SSC                                          20 ml

0.2% SDS                                             10% SDS                                         80ml

dH2O to                                                                                                     4000ml

 

Blue Juice:

Final conc.                                          Stock                                          Vol.                                         Vol.

70% Glycerol                                      100%                                         35 ml                                     70 ml

0.5×TBE                                               5×                                             5 ml                                      10 ml

0.2% SDS                                           10%                                            1 ml                                        2 ml

20 mM  EDTA                                      0.5 M                                           2 ml                                         4 ml

5 mg/ml  Bromphenol Blue                                                                     0.25 g                                      0.5 g

5 mg/ml  Xylene cyanol                                                                          0.25 g                                      0.5 g

dH2O to                                                                                                 50 ml                                      100 ml

 

EB (10 mg/ml):

ehidium bromide                                      1 g

dH2O to                                                 100 ml

Stir on a magnetic stirrer for several hours. Transfer the solution to

a dark bottle and store at 4.

The concentration of work solution: 0.5 μg/μl (50 μl  stock solution

In 1000 ml  dH2O).

 

Decontamination of EB:

Reduce the concentration of EB <0.5 mg/ml, add 1 volume of

0.5 M  KMnO4,mix carefully then add 1 volume of 2.5 N  HCl,

mix carefully and allow the solution to stand at room temperature

for several hours. Add 1 volume of 2.5 N  NaOH, mix and discard.


  RNA操作试剂

Stock Solution:

1M NaAc(PH7.0):82g NaAc 先加一定量ddH2O,NaOHPH值至7.0再用ddH2O定容至1L灭菌

0.5M EDTA(PH8.0): 186.1g EDTA先加一定量ddH2O, NaOHPH值至8.0,再用ddH2O定容至1L灭菌


10×MOPS buffer: (DEPC水配再灭菌)
MOPS                                          41.85g
1M NaAc(PH7.0)                             50ml
0.5M EDTA(PH8.0)                          20ml
先加一定量DEPC再用4N NaOH PH 7.0约加7ml),再用DEPC水定容至1L灭菌


1M NaH2PO4  buffer ( PH7.2):
NaH2PO4                                         71g
H3PO4(85%)                                    4ml
用灭菌的DEPC水定容至1L


20×SSC:
NaCl                                                175.3g
Na3Citrate                                         88.2g
ddH2O定容至1L灭菌


10%SDS:
SDS                                                  100.0g
用灭菌的ddH2O定容至1L(将水加热到68℃有助于溶解)


Work Solution

Sample buffer:
Deionized formamide                                        1000 ml
10×MOPS buffer                                               200 ml
37% formaldehyde                                           320 ml

Blue juice(loading buffer):
Glycerol                                                            70ml
5×TBE                                                              10ml
10%SDS                                                            2ml
0.5M EDTA(PH8.0)                                              4ml
Bromphenol Blue                                                 0.5g
Xylene Cyanol                                                     0.5g
加灭菌的ddH2O定容至                                      100ml


Hybridization buffer:
1M NaH2PO4 buffer                                            500ml
0.5M EDTA(PH8.0)                                             2ml
10% SDS                                                           70g
BSA                                                                    10g
用灭菌的DEPC水定容至1L贮存于室温下

洗膜液Ⅰ:for 1 littre
20×SSC                                                             100ml
10%SDS                                                            10ml

洗膜液Ⅱ:for 1 littre
20×SSC                                                            25ml
10%SDS                                                            10ml

洗膜液Ⅲ:for 1 littre
20×SSC                                                              5ml
10%SDS                                                             10ml

4×SSC:
20×SSC                                                               200ml
用灭菌的DEPC水定容至1L


2×SSC:
20×SSC                                                               100ml
用灭菌的ddH2O定容至1L